2020年，被选召的孩子们都长大成人。伴随着未知数码兽的出现，平静的生活被打破，世界即将再次掀起异变。在所有人的命运即将改变之时，八神太一等人再次集结。然而，伴随着战斗的拉响，他们面临与数码宝贝的分别。自1991年夏天开始的漫长冒险，即将迎来终结之时。这是八神太一和数码宝贝们故事的最终篇章，这是他们最后的冒险。

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在高达00第二季中，利冯兹·阿尔马克与「Celestial Being」的战斗以真正的变革者刹那·F·清英等人的胜利拉上了帷幕。独立治安维持部队「A-Laws」解体，新联邦政府成立，世界终于走向了和平